Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms