Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms