Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms