Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ISXQ2M1V0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms