Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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