Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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