Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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