Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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