Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms