Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CNGA3Q16281 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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