Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NEDD8Q15843 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NEDD8Q15843 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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