Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF11Q15544 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms