Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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RAB35Q15286 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB35Q15286 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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