Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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