Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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