Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOFQ13790 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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APOFQ13790 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOFQ13790 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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