Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms