Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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