Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms