Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ATRQ13535 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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