Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCGQ13326 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 627.6 ms