Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.925e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MLF2-209ENST00000541346 1234 ntTSL 520.71■□□□□ 0.916e-16■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.95e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.885e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.855e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.845e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SPSB3-202ENST00000563668 1509 ntTSL 220.29■□□□□ 0.845e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.846e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.835e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.85e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RNF215-201ENST00000215798 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.03■□□□□ 0.85e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.785e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MLF2-205ENST00000537126 851 ntTSL 519.85■□□□□ 0.776e-16■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TEX264-213ENST00000489026 800 ntTSL 219.71■□□□□ 0.755e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.735e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TNIP2-202ENST00000502256 923 ntTSL 219.2■□□□□ 0.665e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.646e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.635e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.65e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NDUFS3-208ENST00000530295 253 ntTSL 318.71■□□□□ 0.595e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.585e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.576e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.565e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.565e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NDUFS3-209ENST00000531351 423 ntTSL 518.31■□□□□ 0.525e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.515e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.485e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.465e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RHNO1-203ENST00000464682 1605 ntTSL 217.91■□□□□ 0.465e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.455e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 UMPS-209ENST00000497791 1691 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.365e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TULP3-205ENST00000540184 978 ntTSL 517.27■□□□□ 0.365e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.315e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.266e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.265e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.255e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.245e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.246e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTMR14-204ENST00000414996 1746 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.236e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RRP8-204ENST00000533907 1989 ntTSL 516.35■□□□□ 0.215e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RNF215-204ENST00000421022 361 ntTSL 216.17■□□□□ 0.185e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-219ENST00000493335 2937 ntTSL 216.1■□□□□ 0.175e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.165e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.165e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.145e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.145e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RRP8-202ENST00000526352 1126 ntTSL 215.8■□□□□ 0.125e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.125e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MBD6-205ENST00000547844 387 ntTSL 515.66■□□□□ 0.15e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DMPK-208ENST00000595361 466 ntTSL 515.49■□□□□ 0.075e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RNF215-210ENST00000631046 468 ntTSL 215.47■□□□□ 0.075e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.065e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 HERC2-202ENST00000562136 632 ntTSL 215.35■□□□□ 0.056e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-213ENST00000460658 5080 ntTSL 515.31■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CTDNEP1-205ENST00000570828 986 ntTSL 314.99□□□□□ -0.016e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ZNRF1-208ENST00000568494 2046 ntTSL 214.76□□□□□ -0.055e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.065e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.075e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MCAM-204ENST00000525586 4865 ntTSL 514.43□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AP1G2-204ENST00000465445 2554 ntTSL 514.41□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.115e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-215ENST00000472911 543 ntTSL 214.29□□□□□ -0.125e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.135e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-225ENST00000535183 1894 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.135e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.135e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.145e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RNF215-209ENST00000630264 534 ntTSL 214.1□□□□□ -0.155e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AP1G2-205ENST00000535852 2471 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.165e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-217ENST00000484546 1269 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AP1G2-203ENST00000460049 2672 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TMEM218-204ENST00000527257 4547 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.195e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.195e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-221ENST00000491777 556 ntTSL 313.77□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AAAS-207ENST00000547520 769 ntTSL 313.67□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MCAM-208ENST00000528533 3164 ntTSL 513.62□□□□□ -0.235e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CYTH2-210ENST00000493260 4652 ntTSL 513.52□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 UMPS-203ENST00000462091 2001 ntTSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.265e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 WSB2-203ENST00000535496 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.286e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-202ENST00000368336 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.35e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-219ENST00000495406 635 ntTSL 213.14□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDK5RAP2-206ENST00000433194 815 ntTSL 313.07□□□□□ -0.325e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MRPS28-208ENST00000521605 437 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.345e-6■□□□□ 10.8
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