Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SKP2Q13309 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SKP2Q13309 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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SKP2Q13309 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKP2Q13309 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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