Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXC1Q12948 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms