Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TWF1Q12792 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TWF1Q12792 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TWF1Q12792 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TWF1Q12792 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TWF1Q12792 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TWF1Q12792 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TWF1Q12792 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TWF1Q12792 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TWF1Q12792 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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