Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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