Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE4DQ08499 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms