Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms