Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms