Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM3AP98173 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms