Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VLDLRP98155 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VLDLRP98155 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VLDLRP98155 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VLDLRP98155 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VLDLRP98155 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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VLDLRP98155 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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VLDLRP98155 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VLDLRP98155 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VLDLRP98155 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VLDLRP98155 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VLDLRP98155 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VLDLRP98155 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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