Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX1P83916 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX1P83916 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX1P83916 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms