Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGDP52209 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGDP52209 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms