Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA4P48169 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA4P48169 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA4P48169 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms