Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AFMP43652 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AFMP43652 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AFMP43652 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AFMP43652 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
AFMP43652 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AFMP43652 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AFMP43652 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms