Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MDH1P40925 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms