Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCKBRP32239 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms