Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms