Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB4P28070 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms