Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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