Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD27P26842 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD27P26842 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD27P26842 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD27P26842 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD27P26842 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms