Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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