Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPREP23469 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPREP23469 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms