Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HRCP23327 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HRCP23327 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HRCP23327 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HRCP23327 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HRCP23327 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HRCP23327 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HRCP23327 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HRCP23327 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms