Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USF1P22415 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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