Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AMY2BP19961 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AMY2BP19961 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AMY2BP19961 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AMY2BP19961 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AMY2BP19961 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AMY2BP19961 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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AMY2BP19961 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AMY2BP19961 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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