Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CXCL3P19876 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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CXCL3P19876 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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CXCL3P19876 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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CXCL3P19876 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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