Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XBP1P17861 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XBP1P17861 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms