Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NME1P15531 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NME1P15531 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NME1P15531 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms