Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms